El italiano Valentino Rossi (Yamaha YZR M 1) consiguió su tercera mejor clasificación de la temporada al ser el más rápido en los entrenamientos oficiales para el Gran Premio de Japón de MotoGP que se disputa en el circuito de Motegi, por delante de los españoles Marc Márquez (Repsol Honda RC 213 V) y Jorge Lorenzo (Yamaha YZR M 1).
La primera buena noticia de la sesión fue el regreso desde el Dokkyo University Hospital de Jorge Lorenzo, quien tuvo que ser trasladado al citado centro, próximo a la localidad de Utsonomiya, para realizarle una serie de pruebas que descartaran cualquier tipo de lesión tras la fuerte caída que sufrió en los terceros entrenamientos libres.
Se fue y volvió en helicóptero para recibir el "apto" de los médicos y continuar con el normal desarrollo de los entrenamientos libres, en cuya cuarta serie logró la tercera plaza como sin nada hubiese sucedido, salvo el monumental susto que se llevó y que por unos instantes le tuvo levemente conmocionado.
El paso previo de la primera clasificación debía dar a conocer los dos nombres propios de pilotos que pasarían a la segunda y que fueron el representante oficial de Aprilia, el español Álvaro Bautista, y el británico Scott Redding (Ducati Desmosedici GP15), quien en el último momento "sacó" de las posiciones que dan acceso a la segunda al alemán Stefan Bradl, quien sufrió una caída sin consecuencias en la curva de entrada al túnel y no pudo defender el segundo puesto que ocupaba hasta entonces.
No tuvo demasiada suerte Bautista que, a las primeras de cambio, se fue por los suelos con su Aprilia RS-GP, mientras por delante Marc Márquez, en su segunda vuelta, ya era el más rápido del fin de semana en MotoGP con 1:44.617. Una vuelta más tarde el líder del equipo Repsol Honda volvió a rebajar su registro para establecer una nueva referencia de la categoría en 1:44.134, más de ocho décimas de segundo por debajo de su inmediato perseguidor, el italiano Andrea Dovizioso y su Ducati Desmosedici GP16, aunque instantes después resurgió la figura de Jorge Lorenzo.
Lorenzo marcó un mejor tiempo de 1:44.399 que le situó segundo a poco mas de dos décimas de Marc Márquez, quien entró en su taller en la cuarta vuelta para salir con la segunda moto. Pero cuando el piloto de Repsol salió nuevamente a pista completó un giro y esperó a no hubiese ningún piloto por detrás para intentar una nueva vuelta rápida.
Acabó tras la estela de Valentino Rossi, una primera vez al "colarse" de trazada en el cuarto y último parcial y una bandera amarilla por la caída del inglés Cal Crutchlow después. Mientras, el italiano se encaramó hasta la primera posición y ello provocó que el de Repsol Honda perdiese unas décimas preciosas que le condenaron a la segunda posición por delante de Lorenzo.
